Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Rpusd2Q149F1 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Rpusd2Q149F1 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Rpusd2Q149F1 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Rpusd2Q149F1 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rpusd2Q149F1 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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