Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms