Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd10P28359 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms