Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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Hoxd9P28357 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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Hoxd9P28357 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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Hoxd9P28357 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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Hoxd9P28357 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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Hoxd9P28357 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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Hoxd9P28357 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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