Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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Sh3bp1P55194 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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Sh3bp1P55194 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Sh3bp1P55194 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms