Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd9P28357 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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