Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Ccl20O89093 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccl20O89093 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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