Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FxnO35943 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FxnO35943 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FxnO35943 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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FxnO35943 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FxnO35943 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FxnO35943 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FxnO35943 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FxnO35943 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FxnO35943 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FxnO35943 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FxnO35943 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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