Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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