Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Lrrc43Q3V0L5 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms