Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
Traf3ip1Q149C2 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Traf3ip1Q149C2 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Traf3ip1Q149C2 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Traf3ip1Q149C2 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms