Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TtrP07309 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TtrP07309 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TtrP07309 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TtrP07309 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TtrP07309 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TtrP07309 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TtrP07309 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TtrP07309 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TtrP07309 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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TtrP07309 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TtrP07309 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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TtrP07309 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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TtrP07309 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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TtrP07309 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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TtrP07309 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TtrP07309 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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TtrP07309 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TtrP07309 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TtrP07309 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TtrP07309 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TtrP07309 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TtrP07309 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TtrP07309 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TtrP07309 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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