Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms