Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Lrrc43Q3V0L5 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms