Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ptchd1Q14B62 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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