Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtpreP49446 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpreP49446 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpreP49446 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtpreP49446 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtpreP49446 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PtpreP49446 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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PtpreP49446 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtpreP49446 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtpreP49446 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtpreP49446 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtpreP49446 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtpreP49446 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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