Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Nedd1P33215 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms