Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd9P28357 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd9P28357 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd9P28357 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Hoxd9P28357 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hoxd9P28357 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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