Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms