Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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