Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Top3bQ9Z321 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Top3bQ9Z321 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms