Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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Col5a3Q9JLI2 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Col5a3Q9JLI2 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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