Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Zfhx4Q9JJN2 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms