Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc9bQ9D6E4 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ttc9bQ9D6E4 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms