Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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