Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp4P35123 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp4P35123 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp4P35123 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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