Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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