Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gja5Q01231 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms