Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd13P70217 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms