Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb2P0C1T1 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms