Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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Ccl20O89093 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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Ccl20O89093 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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