Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms