Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp27Q8CEG8 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp27Q8CEG8 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp27Q8CEG8 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp27Q8CEG8 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp27Q8CEG8 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Usp27Q8CEG8 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp27Q8CEG8 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.2 ms