Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Trim35Q8C006 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Trim35Q8C006 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Trim35Q8C006 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Trim35Q8C006 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Trim35Q8C006 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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Trim35Q8C006 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
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