Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc18Q640L5 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms