Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cpne9Q1RLL3 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cpne9Q1RLL3 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms