Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms