Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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