Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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Cldn19Q9ET38 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Cldn19Q9ET38 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Cldn19Q9ET38 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Cldn19Q9ET38 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn19Q9ET38 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn19Q9ET38 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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