Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim35Q8C006 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Trim35Q8C006 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Trim35Q8C006 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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