Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc28Q80XJ3 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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