Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Kdm5dQ62240 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Kdm5dQ62240 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms