Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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TtrP07309 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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TtrP07309 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TtrP07309 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TtrP07309 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TtrP07309 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TtrP07309 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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