Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrit3W8DXL4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms