Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vstm4T1NXB5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vstm4T1NXB5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms