Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac6Q9Z2V5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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