Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms