Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt16Q9Z2K1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms