Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn6Q9Z262 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn6Q9Z262 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms