Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2aQ9Z255 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2aQ9Z255 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2aQ9Z255 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube2aQ9Z255 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms